「人間科学合同演習Ⅰ」は、人間科学研究科独自のスタイルで実施している、研究科共通の必修科目です。4つの異なる専門分野の大学院生が主体的に運営し、それぞれの研究計画や研究成果を発表し、質疑応答を行います。専門的な内容を専門外の人にわかりやすく伝える能力や、隣接領域についての理解、研究活動にかかわる主体性などを培うことを目的としています。研究科長と各分野の教員が合同で担当し、それぞれの専門分野から、あるいは専門外の立場から指導を行います。
「演習Ⅰ」と「特別研究Ⅰ」は、それぞれの専門分野の指導教員による必修科目で、大学院生の修士論文のテーマに応じて、研究遂行に必要な実験手法、調査手法、データ解析技術、文献講読、論文作成などのためのきめ細かい指導を行います。
加えて、所属する専門分野の講義科目の中から履修する専門選択必修科目、夏休みなどを利用して集中講義の形式で開講される「人間科学特別講義」や「情報科学特論」、文学研究科英文学専攻・通訳・翻訳コースとの連携科目である「専門領域通訳特論（自然科学）」などの関連選択科目があります。

このほか、本取組で実施するサイエンスのための語学研修は1年次前期から、サイエンス・アウトリーチは1年次後期から実施します。短期インターンシップは1年次の夏期休暇に実施することができます。長期インターンシップを行う場合には、1年次の前期にしっかりとした準備期間を設け、後期に実施するのが原則です。実施にあたっては、随時インターンシップ受入れ先、指導教員、人間科学部GP推進室コーディネーターとの緊密な連携のもとで、大学院生の学修に配慮しつつ行います。

「人間科学合同演習Ⅱ」、「演習Ⅱ」、「特別研究Ⅱ」の必修科目、また、専門選択必修科目、関連選択科目等についても開講科目が変わりますが、1年次と同じ要領で履修することになります。
サイエンス・アウトリーチやサイエンスのための語学研修は、引き続き実施します。
修士論文については、1月末の提出締切後、研究科全体で行う修士論文公開発表会と主査および2名の副査による口頭試問があり、そこで付された意見や質問をもとに修正を施し、最終的に2月下旬に提出します。